Composição
A Comissão é composta por 11 membros eleitos pela Assembleia da UA de peritos nomeados pelos Estados-Parte da Carta. A Assembleia tem em conta uma representação geográfica equitativa e de género na eleição dos membros da Comissão. Os membros da Comissão são eleitos para um mandato de seis anos e podem ser reeleitos.
Uma vez eleitos, os comissários actuam na sua capacidade pessoal e não como representantes dos seus respectivos países. Anteriormente, alguns membros da Comissão tiveram altos cargos políticos a nível nacional, o que afecta a independência da Comissão. A UA em Abril de 2005 emitiu uma nota verbal aos Estados-Membros prescrevendo orientações para a nomeação de membros para a Comissão, que excluía os altos funcionários e representantes diplomáticos.
Direcção da Comissão
A Comissão elege o seu presidente e vice-presidente como Bureau da Comissão. Estes são eleitos para um mandato de dois anos e são elegíveis para reeleição uma vez. O Bureau coordena as actividades da Comissão e supervisiona e avalia o trabalho do Secretariado da Comissão. O Bureau está igualmente habilitado a tomar decisões sobre questões de emergência entre as sessões da Comissão. No entanto, é obrigada a apresentar um relatório aos membroa sobre a situação na sessão seguintes da Comissão.
Secretariado da Comissão
O presidente da Comissão da UA nomeia o Secretário da Comissão Africana, incluindo outro pessoal de apoionecessário para o desempenho eficaz do mandato da Comissão. O secretariado fornece apoio administrativo, técnico e logístico à Comissão.
